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全基因組檢測(cè)分析平臺(tái)將疑似病例基因分析縮至半小時(shí)

2020-02-02 08:34 作者:安卓在線 來源:網(wǎng)絡(luò)整理 瀏覽:

摘要::全基因組檢測(cè)闡明平臺(tái),新【CNMO新聞】浙江省疾控中心于2月1日上線自動(dòng)化的全基因組檢測(cè)闡明平臺(tái),浙江全基因組檢測(cè)闡明平臺(tái)由浙江省疾病防范節(jié)制中心、阿里達(dá)摩院醫(yī)療AI團(tuán)隊(duì)和杰毅生物技能公司配合研發(fā)。

  【CNMO聞】浙江省疾控中心于2月1日上線自動(dòng)化的全基因組檢測(cè)闡明平臺(tái),浙江全基因組檢測(cè)闡明平臺(tái)由浙江省疾病防范節(jié)制中心、阿里達(dá)摩院醫(yī)療AI團(tuán)隊(duì)和杰毅生物技能公司配合研發(fā)。浙江省疾控中心基因測(cè)序認(rèn)真人孫逸博士先容說,這個(gè)平臺(tái)基于阿里云的強(qiáng)大算力與達(dá)摩院算法可覺得病毒的理會(huì)提供支撐,基于該平臺(tái),將來還可以在短時(shí)間內(nèi)將檢測(cè)范疇包圍整個(gè)確診病例,也為后續(xù)疫苗與藥物研發(fā)打下了堅(jiān)硬基本。

全基因組檢測(cè)闡明平臺(tái)將疑似病例基因闡明縮至半小時(shí)

  按照果真信息顯示,新型冠狀病毒全基因組序列全長(zhǎng)29847bp,臨床診斷需要將患者樣本與該病毒基因序羅列辦比對(duì)才氣確定診斷功效。今朝醫(yī)院普遍回收核酸檢測(cè)要領(lǐng),其只能檢測(cè)到病毒基因的局部。由于病毒存在變異的大概性,對(duì)付整個(gè)基因序列來說這種檢測(cè)要領(lǐng)猶如瞽者摸象,一旦病毒產(chǎn)生變異,就大概呈現(xiàn)漏檢的環(huán)境。

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  新型冠狀病毒肺炎疫情產(chǎn)生后,達(dá)摩院算法專家顧斐博士當(dāng)即奔赴浙江省疾控中心,第一時(shí)間針對(duì)新型冠狀病毒基因舉辦特征闡明,并推出多個(gè)算法模子。在序列比對(duì)進(jìn)程中,達(dá)摩院對(duì)算法增加了漫衍式設(shè)計(jì),有效晉升比對(duì)效率;在病毒序列拼接階段利用漫衍式設(shè)計(jì)的de Bruijn圖算法,變異病毒也能精準(zhǔn)檢測(cè)。

  自動(dòng)化的全基因組檢測(cè)闡明平臺(tái)回收差異于核酸檢測(cè)要領(lǐng)的全基因組檢測(cè)技能,對(duì)疑似病例的病毒樣本舉辦全基因組序列闡明比對(duì),可以或許有效防備病毒變異發(fā)生的漏檢。平臺(tái)上線后,可將本來數(shù)小時(shí)的疑似病例基因闡明縮短至半小時(shí),大幅縮短確診時(shí)間,并能精準(zhǔn)檢測(cè)出病毒的變異環(huán)境。大幅提高疑似病例簡(jiǎn)直診速度和精確率。



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